我馆科研人员与北京大学地球空间科学学院（北京大学地质博物馆）、美国加利福尼亚大学（戴维斯）地质系、意大利米兰地质系等的专家合作，先后在国内外学术期刊公开发表多篇科研成果，在以下方面取得重大突破：

1、2014年，我馆科研团队发现世界上最早的带胚胎的鱼龙化石，将鱼龙胎生的记录向前推进1000万年，并提出鱼龙胎生陆地起源的新观点，相关研究成果在国际知名科技期刊PLOS ONE上发表。

2、2014年，我馆科研团队首次在该地区发现确切的始鳍龙类化石，该标本是目前世界上最早的鳍龙类化石，相关研究成果在国际知名科技期刊JVP上发表。

3、2014年，我馆科研团队首次发现了具有两栖生活习性的原始鱼龙——柔腕短吻龙，支序分析表明其为鱼龙类的祖先，填补了鱼龙起源演化的确实环节，相关成果在国际权威科技期刊Nature上发表。

4、2014年，我馆科研团队发现了安徽第一个蜥脚类恐龙属种——安徽黄山龙，属安徽地区发现的第二个恐龙属种，丰富了安徽地区恐龙的多样性，相关内容在古脊椎动物学报上发表。

5、2015年，我馆科研团队首次在巢湖龙标本中发现存在中间腕骨的发育，这是在鱼龙类群中首次发现，相关成果在国际知名科技期刊JVP上发表。

6、2016年，在国际知名科技期刊Peer J发表论文，发现产自于辽西建昌的早白垩世今鸟类新类型——安地博长嘴鸟，丰富了早白垩世今鸟类的多样性。

7、2016年，在国际知名科技期刊Scientific Reports发表论文，发现同时代体型最大的原始鱼龙形动物新材料——小头刚体龙，并讨论原始鱼龙多样性演化。

8、2017年，在《科学通报》上发表论文，在黄山地区发现恐龙蛋新类型——休宁伞形蛋，进一步丰富了皖南地区恐龙化石群的多样性组成。

9、2017年，在国际知名科技期刊PRSB发表论文，对鱼龙类群的起源分异时间进行分析，讨论演化速率的变化对计算起源时间的影响，估算巢湖龙类的起源分异时间估算为248.8 Ma与250.2 Ma间。

10、2018年，在国际知名科技期刊Scientific Reports发表论文，首次在早白垩世今鸟类化石中发现盐腺结构，为非鸟类恐龙中盐腺的存在提供了最早的化石证据。

11、2018年，在国际知名科技期刊Historical Biology发表论文，发现一蜥脚类新属种——地博安徽龙，这是中国东部第二个马门溪龙科恐龙，丰富了蜥脚类恐龙的多样性。

12、2018年，在国际知名科技期刊Scientific Reports发表论文，在巢湖龙中识别出性二型现象。

13、2019年，在国际知名科技期刊Peer J发表论文，建立了巢湖龙一新物种——短腿巢湖龙，进一步丰富了巢湖动物群的多样性。

14、2020年，在国际知名科技期刊Scientific Reports发表论文，基于CT扫描和三维重建技术，得到了柔腕短吻龙的牙齿信息，对其食性等方面的研究带来了帮助。